Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC6

Rilpl1, RILP-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl1Q9JJC6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rilpl1Q9JJC6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rilpl1Q9JJC6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rilpl1Q9JJC6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rilpl1Q9JJC6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rilpl1Q9JJC6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rilpl1Q9JJC6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rilpl1Q9JJC6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rilpl1Q9JJC6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rilpl1Q9JJC6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rilpl1Q9JJC6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rilpl1Q9JJC6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rilpl1Q9JJC6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rilpl1Q9JJC6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rilpl1Q9JJC6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rilpl1Q9JJC6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rilpl1Q9JJC6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rilpl1Q9JJC6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rilpl1Q9JJC6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms