Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cacna1fQ9JIS7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cacna1fQ9JIS7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cacna1fQ9JIS7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cacna1fQ9JIS7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cacna1fQ9JIS7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cacna1fQ9JIS7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna1fQ9JIS7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna1fQ9JIS7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna1fQ9JIS7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacna1fQ9JIS7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna1fQ9JIS7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacna1fQ9JIS7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cacna1fQ9JIS7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacna1fQ9JIS7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacna1fQ9JIS7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cacna1fQ9JIS7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms