Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHA8

Vwa7, von Willebrand factor A domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa7Q9JHA8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa7Q9JHA8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa7Q9JHA8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa7Q9JHA8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa7Q9JHA8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa7Q9JHA8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa7Q9JHA8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa7Q9JHA8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa7Q9JHA8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vwa7Q9JHA8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa7Q9JHA8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa7Q9JHA8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa7Q9JHA8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa7Q9JHA8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms