Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zcchc17Q9ESX4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Zcchc17Q9ESX4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zcchc17Q9ESX4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zcchc17Q9ESX4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zcchc17Q9ESX4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zcchc17Q9ESX4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zcchc17Q9ESX4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms