Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,35■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20,34■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20,33■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20,33■□□□□ 0,85
DysfQ9ESD7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,33■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,33■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20,33■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20,32■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20,3■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20,3■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20,28■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20,27■□□□□ 0,84
DysfQ9ESD7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
DysfQ9ESD7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20,26■□□□□ 0,83
DysfQ9ESD7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
DysfQ9ESD7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,25■□□□□ 0,83
DysfQ9ESD7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
DysfQ9ESD7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
DysfQ9ESD7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20,25■□□□□ 0,83
DysfQ9ESD7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
DysfQ9ESD7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20,24■□□□□ 0,83
DysfQ9ESD7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
DysfQ9ESD7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
DysfQ9ESD7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20,22■□□□□ 0,83
DysfQ9ESD7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20,21■□□□□ 0,83
DysfQ9ESD7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20,18■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20,18■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,18■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20,17■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20,17■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20,17■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20,16■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20,15■□□□□ 0,82
DysfQ9ESD7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20,14■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20,14■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20,14■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20,11■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20,11■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20,11■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,1■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,1■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20,1■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20,1■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20,08■□□□□ 0,81
DysfQ9ESD7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
DysfQ9ESD7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
DysfQ9ESD7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20,06■□□□□ 0,8
DysfQ9ESD7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
DysfQ9ESD7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
DysfQ9ESD7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
DysfQ9ESD7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
DysfQ9ESD7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
DysfQ9ESD7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
DysfQ9ESD7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20,03■□□□□ 0,8
DysfQ9ESD7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
DysfQ9ESD7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms