Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spock2Q9ER58 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spock2Q9ER58 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spock2Q9ER58 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spock2Q9ER58 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spock2Q9ER58 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spock2Q9ER58 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spock2Q9ER58 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spock2Q9ER58 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spock2Q9ER58 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spock2Q9ER58 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spock2Q9ER58 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Spock2Q9ER58 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spock2Q9ER58 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spock2Q9ER58 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spock2Q9ER58 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spock2Q9ER58 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spock2Q9ER58 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spock2Q9ER58 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spock2Q9ER58 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spock2Q9ER58 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spock2Q9ER58 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spock2Q9ER58 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spock2Q9ER58 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spock2Q9ER58 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spock2Q9ER58 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spock2Q9ER58 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spock2Q9ER58 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spock2Q9ER58 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spock2Q9ER58 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spock2Q9ER58 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spock2Q9ER58 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spock2Q9ER58 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spock2Q9ER58 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spock2Q9ER58 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms