Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capn12Q9ER56 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn12Q9ER56 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn12Q9ER56 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn12Q9ER56 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capn12Q9ER56 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capn12Q9ER56 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn12Q9ER56 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn12Q9ER56 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn12Q9ER56 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn12Q9ER56 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn12Q9ER56 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn12Q9ER56 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn12Q9ER56 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn12Q9ER56 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Capn12Q9ER56 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Capn12Q9ER56 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms