Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr9Q9EQU3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr9Q9EQU3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr9Q9EQU3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr9Q9EQU3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlr9Q9EQU3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlr9Q9EQU3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlr9Q9EQU3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr9Q9EQU3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr9Q9EQU3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr9Q9EQU3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr9Q9EQU3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tlr9Q9EQU3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr9Q9EQU3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tlr9Q9EQU3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr9Q9EQU3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tlr9Q9EQU3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms