Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca3a2Q9EQR4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca3a2Q9EQR4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca3a2Q9EQR4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca3a2Q9EQR4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3a2Q9EQR4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms