Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms