Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrotQ9DC50 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CrotQ9DC50 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CrotQ9DC50 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CrotQ9DC50 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms