Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csnk1dQ9DC28 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Csnk1dQ9DC28 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csnk1dQ9DC28 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csnk1dQ9DC28 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Csnk1dQ9DC28 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Csnk1dQ9DC28 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csnk1dQ9DC28 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csnk1dQ9DC28 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csnk1dQ9DC28 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csnk1dQ9DC28 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csnk1dQ9DC28 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csnk1dQ9DC28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csnk1dQ9DC28 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Csnk1dQ9DC28 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csnk1dQ9DC28 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csnk1dQ9DC28 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csnk1dQ9DC28 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Csnk1dQ9DC28 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Csnk1dQ9DC28 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csnk1dQ9DC28 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csnk1dQ9DC28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csnk1dQ9DC28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csnk1dQ9DC28 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csnk1dQ9DC28 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csnk1dQ9DC28 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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