Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syde1Q9DBZ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syde1Q9DBZ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Syde1Q9DBZ9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syde1Q9DBZ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syde1Q9DBZ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syde1Q9DBZ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syde1Q9DBZ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syde1Q9DBZ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syde1Q9DBZ9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syde1Q9DBZ9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Syde1Q9DBZ9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Syde1Q9DBZ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syde1Q9DBZ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syde1Q9DBZ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syde1Q9DBZ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms