Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf6Q9DBU5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf6Q9DBU5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf6Q9DBU5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf6Q9DBU5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf6Q9DBU5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf6Q9DBU5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf6Q9DBU5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf6Q9DBU5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf6Q9DBU5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rnf6Q9DBU5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf6Q9DBU5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf6Q9DBU5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf6Q9DBU5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf6Q9DBU5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms