Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc54Q9DAL3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc54Q9DAL3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc54Q9DAL3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms