Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9W1

Pifo, Protein pitchfork, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PifoQ9D9W1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PifoQ9D9W1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PifoQ9D9W1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PifoQ9D9W1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PifoQ9D9W1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PifoQ9D9W1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PifoQ9D9W1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PifoQ9D9W1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PifoQ9D9W1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PifoQ9D9W1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PifoQ9D9W1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms