Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg7Q9D906 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg7Q9D906 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg7Q9D906 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg7Q9D906 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg7Q9D906 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg7Q9D906 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg7Q9D906 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg7Q9D906 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg7Q9D906 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg7Q9D906 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg7Q9D906 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg7Q9D906 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg7Q9D906 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg7Q9D906 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atg7Q9D906 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg7Q9D906 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms