Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rexo2Q9D8S4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rexo2Q9D8S4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo2Q9D8S4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo2Q9D8S4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rexo2Q9D8S4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo2Q9D8S4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rexo2Q9D8S4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rexo2Q9D8S4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo2Q9D8S4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms