Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms