Protein–RNA interactions for Protein: Q9D880

Timm50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm50Q9D880 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm50Q9D880 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm50Q9D880 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm50Q9D880 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Timm50Q9D880 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Timm50Q9D880 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Timm50Q9D880 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Timm50Q9D880 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timm50Q9D880 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Timm50Q9D880 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Timm50Q9D880 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms