Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx4ipQ9D7Y9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx4ipQ9D7Y9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx4ipQ9D7Y9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slx4ipQ9D7Y9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slx4ipQ9D7Y9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4ipQ9D7Y9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4ipQ9D7Y9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4ipQ9D7Y9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx4ipQ9D7Y9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx4ipQ9D7Y9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4ipQ9D7Y9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slx4ipQ9D7Y9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slx4ipQ9D7Y9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms