Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptp4a3Q9D658 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptp4a3Q9D658 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptp4a3Q9D658 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptp4a3Q9D658 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms