Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc39Q9D5Y1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc39Q9D5Y1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc39Q9D5Y1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc39Q9D5Y1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc39Q9D5Y1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc39Q9D5Y1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc39Q9D5Y1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc39Q9D5Y1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc39Q9D5Y1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc39Q9D5Y1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc39Q9D5Y1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc39Q9D5Y1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc39Q9D5Y1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms