Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sf3a3Q9D554 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf3a3Q9D554 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3a3Q9D554 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3a3Q9D554 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms