Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf6Q9D4J7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phf6Q9D4J7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf6Q9D4J7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf6Q9D4J7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phf6Q9D4J7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf6Q9D4J7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms