Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a4cQ9D3F6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a4cQ9D3F6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a4cQ9D3F6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms