Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necap2Q9D1J1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Necap2Q9D1J1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necap2Q9D1J1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Necap2Q9D1J1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Necap2Q9D1J1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms