Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl53Q9D1H8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl53Q9D1H8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mrpl53Q9D1H8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl53Q9D1H8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms