Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cthrc1Q9D1D6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cthrc1Q9D1D6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cthrc1Q9D1D6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cthrc1Q9D1D6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cthrc1Q9D1D6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cthrc1Q9D1D6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cthrc1Q9D1D6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cthrc1Q9D1D6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cthrc1Q9D1D6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cthrc1Q9D1D6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cthrc1Q9D1D6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cthrc1Q9D1D6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cthrc1Q9D1D6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cthrc1Q9D1D6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cthrc1Q9D1D6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cthrc1Q9D1D6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cthrc1Q9D1D6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms