Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tspan11Q9D1D1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan11Q9D1D1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan11Q9D1D1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan11Q9D1D1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan11Q9D1D1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan11Q9D1D1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan11Q9D1D1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan11Q9D1D1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan11Q9D1D1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan11Q9D1D1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan11Q9D1D1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Tspan11Q9D1D1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tspan11Q9D1D1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan11Q9D1D1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tspan11Q9D1D1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan11Q9D1D1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan11Q9D1D1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan11Q9D1D1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms