Protein–RNA interactions for Protein: Q9D110

Mthfs, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfsQ9D110 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MthfsQ9D110 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MthfsQ9D110 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MthfsQ9D110 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MthfsQ9D110 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MthfsQ9D110 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MthfsQ9D110 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MthfsQ9D110 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MthfsQ9D110 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MthfsQ9D110 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MthfsQ9D110 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MthfsQ9D110 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MthfsQ9D110 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MthfsQ9D110 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MthfsQ9D110 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MthfsQ9D110 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MthfsQ9D110 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MthfsQ9D110 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MthfsQ9D110 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MthfsQ9D110 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MthfsQ9D110 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MthfsQ9D110 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MthfsQ9D110 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MthfsQ9D110 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MthfsQ9D110 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MthfsQ9D110 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MthfsQ9D110 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MthfsQ9D110 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MthfsQ9D110 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MthfsQ9D110 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MthfsQ9D110 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MthfsQ9D110 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms