Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21,1■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21,09■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21,06■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21,04■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Mrto4Q9D0I8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Mrto4Q9D0I8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20,94■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20,92■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Mrto4Q9D0I8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Mrto4Q9D0I8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Mrto4Q9D0I8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Mrto4Q9D0I8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Mrto4Q9D0I8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20,88■□□□□ 0,93
Mrto4Q9D0I8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54,2 ms