Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf9Q9D0B0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf9Q9D0B0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf9Q9D0B0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf9Q9D0B0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf9Q9D0B0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf9Q9D0B0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf9Q9D0B0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf9Q9D0B0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf9Q9D0B0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms