Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spc24Q9D083 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spc24Q9D083 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spc24Q9D083 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms