Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZD5

Mtif3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtif3Q9CZD5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mtif3Q9CZD5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtif3Q9CZD5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtif3Q9CZD5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtif3Q9CZD5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtif3Q9CZD5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtif3Q9CZD5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtif3Q9CZD5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtif3Q9CZD5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtif3Q9CZD5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtif3Q9CZD5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtif3Q9CZD5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtif3Q9CZD5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtif3Q9CZD5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtif3Q9CZD5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtif3Q9CZD5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mtif3Q9CZD5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtif3Q9CZD5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtif3Q9CZD5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtif3Q9CZD5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtif3Q9CZD5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtif3Q9CZD5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtif3Q9CZD5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtif3Q9CZD5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtif3Q9CZD5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtif3Q9CZD5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtif3Q9CZD5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtif3Q9CZD5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtif3Q9CZD5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtif3Q9CZD5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtif3Q9CZD5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtif3Q9CZD5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtif3Q9CZD5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtif3Q9CZD5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtif3Q9CZD5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtif3Q9CZD5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtif3Q9CZD5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtif3Q9CZD5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms