Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CXL3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CXL3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CXL3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CXL3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CXL3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CXL3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CXL3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CXL3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CXL3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CXL3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CXL3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CXL3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9CXL3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9CXL3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9CXL3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9CXL3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9CXL3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9CXL3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms