Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ist1Q9CX00 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ist1Q9CX00 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Ist1Q9CX00 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ist1Q9CX00 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms