Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpusd4Q9CWX4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd4Q9CWX4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms