Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufaf1Q9CWX2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufaf1Q9CWX2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndufaf1Q9CWX2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufaf1Q9CWX2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms