Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930519P11RikQ9CUJ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930519P11RikQ9CUJ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930519P11RikQ9CUJ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms