Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rprd1bQ9CSU0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms