Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl28Q9CR40 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Klhl28Q9CR40 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klhl28Q9CR40 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl28Q9CR40 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl28Q9CR40 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 638.7 ms