Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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