Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp5f1Q9CQQ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5f1Q9CQQ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5f1Q9CQQ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms