Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chchd5Q9CQP3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chchd5Q9CQP3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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