Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc2Q9CQP2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc2Q9CQP2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc2Q9CQP2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms