Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp1b2Q9CQD4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp1b2Q9CQD4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp1b2Q9CQD4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp1b2Q9CQD4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.2 ms