Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudcd2Q9CQ48 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd2Q9CQ48 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd2Q9CQ48 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nudcd2Q9CQ48 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms