Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska1Q9CPV1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska1Q9CPV1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska1Q9CPV1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska1Q9CPV1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ska1Q9CPV1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ska1Q9CPV1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ska1Q9CPV1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.8 ms