Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930519G04RikQ9CPT7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930519G04RikQ9CPT7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930519G04RikQ9CPT7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930519G04RikQ9CPT7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms